ベースラインとフォロー中の結核菌の遺伝子型の分子的研究

BMC 感染症第 23 巻、記事番号: 566 (2023) この記事を引用

メトリクスの詳細

結核（TB）の流行は依然として世界的な主要な健康問題であり、エスワティニも例外ではありません。 私たちの研究では、エスワティニで循環している遺伝子型を調査し、ベースライン（治療開始時）と結核治療中の追跡調査でそれらを比較しました。

390 人 (n = 390) の参加者が紹介クリニックから前向きに登録され、対象基準を満たした患者が研究に含まれました。 合計 103 人の参加者がベースラインと 6 か月以内の追跡調査で検体を提供しました。 結核菌 (M.tb) 株は、GeneXpert® MTB/RIF アッセイ (Cephied、米国) および Ziehl-Neelsen (ZN) 顕微鏡法によって、それぞれベースラインおよびフォローアップの時点で検出されました。 収集された 206 個の検体は汚染除去され、BACTEC™ MGIT™ 960 Mycobacteria Culture System (Becton Dickinson、USA) で培養されました。 薬物感受性検査は、ベースラインとフォローアップの両方の時点で実施されました。 DNA抽出後、ベースライン株とフォローアップ株の両方でスポリゴタイピングを実行しました。

少なくとも 1 つの第一選択薬に対する耐性は、フォローアップ検体と比較してベースラインでより高く検出され、そのほとんどが多剤耐性 (MDR)-TB に発展しました。 合計 4 つの系統と 20 の遺伝子型が検出されました。 系統の分布はエスワティニのさまざまな地域で異なりました。 ヨーロッパ系アメリカ人の系統が 46.12% (95/206) で最も多く、次いで東アジア系が 24.27% (50/206) でした。 インド洋地域は9.71%(20/206)、中央アジアは1.94%(4/206)。 さらに、高い割合で北京遺伝子型が 24.27% (50/206)、S 遺伝子型が 16.50% (34/206) で検出されました。 マンジニ地域から収集された追跡検体では、北京の遺伝子型が 48.9% (23/47) で優勢でした (p = 0.001)。 追跡検体のかなりの割合でMDR-TBが発症し(p = 0.001)、ほとんどの追跡検体では北京が主要な遺伝子型でした(p < 0.000)。

エスワティニは高い M.tb 遺伝子型の多様性を持っています。 結核感染者のかなりの割合が追跡検体で MDR-TB に関連する北京遺伝子型を有していたため、地域全体での感染を示しています。

査読レポート

結核 (TB) は依然として、毎年何百万人もの人々の健康不良の原因となっている世界的な主要な健康問題です [1]。 エスワティニ王国では、結核の通知と発生率は過去10年間で着実に減少しており、2009年のピーク発生率は人口10万人あたり1,190人でしたが、2018年には人口10万人あたり329人の低い発生率となりました[2]。 薬剤耐性結核（DR-TB）の通知は、同じ期間の薬剤感受性結核の通知を反映していました。 しかし、DR-TB は最近までサハラ以南アフリカ地域のほとんどの結核プログラムで適切に追跡されていませんでした [3]。 エスワティニでは、多剤耐性結核(MDR-TB)患者を含む、治療中にDR-TBを発症する人の割合が年々増加しています。 耐性が高い市中感染によるものなのか、不適切な治療により新たに生じたものなのか、あるいはその両方によるものなのかを確認することが重要です。 MDR-TB は、結核疾患の治療に使用される少なくともイソニアジド (INH) およびリファンピン (RIF) 薬剤に対する耐性として定義され、診断と治療がより難しく、好ましくない転帰を伴います [4]。 さらに、DR-TB は結核患者とプログラムが失敗していることを示すだけでなく、両方の費用がより高価になります [5]。 エスワティニは結核撲滅に尽力しており、当時の首相は 2011 年にこの病気を国家非常事態と宣言しました [6]。 この研究は、エスワティニ王国の 4 つの主要な地域センターで治療を受けた日常的な患者から収集された結核菌 (M.tb) の遺伝子型を特徴付けることを目的としています。

Eswatini 臨床検査室では、結核と推定される患者の診断に喀痰塗抹顕微鏡検査と GeneXpert® MTB/RIF アッセイ (Cephied、米国) を使用しています。 さらに、検出された結核検体の培養および薬剤感受性は、薄層寒天、Löwenstein-Jensen および Bactec MGIT™ TB システム法を使用して測定されます。 重要なことは、効果的な結核制御戦略のために結核菌株の検出を特定することである。 循環している結核遺伝子型の菌株遺伝子型を特定することは、分子疫学と感染パターンを理解するのに役立ちます。 結核の流行を調査し理解する能力を拡大することが報告されている分子疫学技術の進歩が文書化されている[7]。 スポリゴタイピングは、国際データベースでデータが共有される資源が限られた地域では依然として費用対効果の高い方法です。 注目すべきことに、エスワティニのような資源が限られた状況では、遺伝子型解析分子技術は従来は使用されていなかった。